制藥廢水的高氨氮問題是主要治理難點之一。現行的脫氮工藝方法，主要是針對較低氨氮濃度的廢水處理，對高含氨氮廢水的處理技術研究較少；隨著國家制藥工業水污染物排放新標準的實施和國家節能減排工作的推進，現行的處理工藝已不能滿足新標準的需要。
華藥通過開展制藥廢水高含氨氮的預處理技術、生物脫氮組合工藝、氨氮超標物化深度處理技術等脫氮技術研究；確立了高氨氮廢水預處理方法和生物脫氮及物化處理工藝技術條件，為制藥行業不同范圍高氨氮廢水的處理提供了全流程的處理工藝參數，即通過物化預處理將高含氨氨廢水中的氨氨濃度降低，控制在生物脫氮適宜濃度范圍；以生物脫氮技術為主，在生物脫氮不能實現穩定達標排放時，結合物化處理方法實現氨氨指標的達標排放。
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