南水北調中線工程將向北京、天津等華北20個大中城市及100多個縣（市）提供生活、工業和農業用水，多年平均調水量為95億立方米。如此巨大的調水工程，究竟要投入多少資金？這筆賬誰來買單？南來之水究竟價幾何？
資金是南水北調工程建設的經濟基礎，截至2014年11月底，國務院南水北調辦已累計下達東、中線一期工程投資總額2541億元。
這么多的錢，從哪里來？記者了解到，在融資過程中，這2541億元的投資金額主要來自4個渠道：第一部分是中央投資，其中中央預算內投資247.3億元，中央預算內專項資金（國債）106.5億元。第二部分是銀行貸款，為478.5億元。第三是南水北調工程建設基金，為196.5億元。基金從山東、江蘇、河南、河北、天津、北京這六個省（市）籌資，通過提高水資源費征收標準增加的收入籌集，可將現行水資源費部分收入等劃入工程基金。第四是國家重大水利工程建設基金，為1512.2億元。國家重大水利工程建設基金是國家為支持南水北調工程建設、解決三峽工程后續問題以及加強中西部地區重大水利工程建設而設立的。
比起工程投資，老百姓們關心更多的是水價問題。
對此，中國工程院院士、中國水科院水資源所名譽所長王浩解釋說，目前國際上通用的是全成本水價的定價機制，即由資源成本、環境成本、生態成本、機會成本、工程成本、企業利潤成本、稅收組成。“俗話說物以稀為貴，可以說，水是南水北調中線受水區最稀缺的資源。這么稀缺的水資源價格應該高一點，這樣才有經濟杠桿，才有動力。但同時，水價調整一定要考慮到弱勢群體，要保證低保人員、生活困難人員的基本生活需要。”王浩表示。
專家指出，南水北調主體工程水價是按“保本、還貸、微利”原則確定，由工程供水成本、利潤和稅金組成，盡管南水北調總成本大，但調水量大，單位成本并不高，到北京的單方水價應該不會超過3元。而且，受水區用戶水價由受水區多水源的綜合成本、水廠加工和運營成本、污水處理費、水資源費等多因素構成，南水北調水價僅是水源成本的一部分，直接影響程度較低。在制定水價時，將充分考慮受水區當前的實際情況，目前還未按水資源的稀缺程度確定水價。因此，受水區不會出現水價大幅度漲價的現象，應該在居民可承受能力范圍之內。
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